После ликвидации в 1937 г. Остехбюро опытовые корабли были переданы НИМТИ, а работы по размагничиванию кораблей с 1936 г. продолжены коллективом ученых, инженеров и военных моряков, сложившимся на базе лаборатории Ленинградского физико-технического института (ЛФТИ) АН СССР. Коллектив этот включал: от ЛФГИ – А.П.Александрова, А.Г.Гаева, Б.М.Тучкевича, П.В.Степанова, В.Р.Регеля и А.Р.Регеля, от НТК ВМС – Б.Е.Гордиевича и И.В.Климова, от НИМТИ ВМС – А.Е.Брыкина, Л.К.Верещагина, И.П.Смирнова, П.А.Роторева, В.А.Карпухина и В.Т.Сухорукова, от ЦНИИ-45 НКСП И.И.Дехтяра и И.М.Фомина, от ЦКБ-55 НКСП – Н.М.Хомякова. Л.В.Черепкова, В.С.Евдокимова и A.M.Антонова. Созданный этим коллективом задел позволил ВМФ приступить с первых дней войны к комплектованию на флотах и флотилиях автономных отрядов и частей службы размагничивания кораблей (СРК). Первые такие СРК в соответствии со сложившимися обстоятельствами начали функционировать на КВФ. Каспийской и Волжской флотилиях. Затем СРК были организованы на Черноморском, Северном и Тихоокеанском флотах, на Краснознаменной Амурской, Ладожской. Онежской. Беломорской, Азовской, Днепровской и Дунайской военных флотилиях. Отряды и группы СРК формировались из специалистов перечисленных организаций при доминирующей роли специалистов ЛФТИ и ЦКБ-55. При этом на строящихся, переоборудуемых и некоторых ремонтируемых кораблях устанавливались электромагнитные обмотки 'системы ЛФТИ', снижающие магнитные поля кораблей в несколько раз.

В связи с успехами, достигнутыми в области размагничивания кораблей, группа ученых, инженеров и моряков была в 1942 г. удостоена Сталинской премии первой степени. В том же году разрозненные отряды и части СРК были объединены в единую службу, курируемую специальным отделом при УК ВМФ. которую возглавил капитан второго ранга Л.С.Гуменюк. В ведении СРК ко времени окончания Великой Отечественной войны находилось несколько контрольно-измерительных магнитных станций (КИМС) и около 20 станций безобмоточного размагничивания (СБР). На морских и базовых тральщиках устанавливались размагничивающие обмотки, а катера-тралылики со стальными корпусами проходили обработку на СБР [10].

Дополнительного рассмотрения заслуживает также и вопрос о разработке вовремя войны неконтактного противоминного оружия. После ликвидации в 1937 г. Остехбюро разработка минного, противоминного и торпедного оружия в конечном итоге была передана вновь образованным ЦКБ-56 и ЦКБ- 57 НКСП. Однако с первых же дней войны стало ясно, что для борьбы с германским 'оружием № Г' – ДИМ. необходим серьезный научный задел. Учитывая значимость в сложившихся условиях проблемы борьбы с ДИМ (с их помощью германское командование намеревалось заблокировать силы нашего флота в базах), к се решению был подключен аппарат АН СССР. Флотским минерам было поручено разоружение обнаруженных ДНМ с целью обеспечения возможности установления характеристик их НВ. Это была первостепенная. необходимая, но тяжелая и крайне опасная работа, сопровождающаяся иногда человеческими жертвами: в целях сохранения секрета своих мин германское командование вводило в схемы НВ гидростатические или оптические датчики, взрывающие мины при попытке ее подъема (т.е. мину приходилось разоружать под водой). С начала 1942 г. работы по изучению германских мин и торпед были сконцентрированы в лаборатории Института телемеханики и автоматики АН СССР, руководимой Б. С. Сотсковым. К работе были привлечены многие талантливые ученые и инженеры (Н. Н.Андреев, Бреховских, О. С. Брон, Кулебякин и др.), ставшие позднее академиками, членам и-корреспондентам и и докторами наук. В конечном итоге лабораторией было идентифицировано около 20 типов НВ мин и торпед противника и установлены сигналы, обеспечивающие их дистанционное срабатывание, что позволило создать необходимое оружие противодействия.

Во время войны начальником УК ВМС был контр-адмирал Н. В. Исаченков, а начальником МТУ – контр-адмирал Н. А. Шибаев. Научными центрами перечисленных управлений были НТК (Научно- технический комитет) ВМС, учрежденный в 1938 г. после передачи НИВКа в НКСП, и НИМТИ. Их начальниками соответственно были контр-адмирал А. А. Жуков (затем Н. В. Алексеев) и Н. А. Брыкин.