Верховный суд приговорил и Ишутина к смертной казни, он был выведен на площадь, надели на него саван, а потом был зачитан другой указ о помиловании и его осудили на бессрочную каторгу в Сибири. В 1879 году Ишутин умер от туберкулеза.
Покушение на императора, ход следствия и приговор подсудимым повлекли за собой большие перемены в государственном управлении, оказавшемся малопригодным для охраны государственных деятелей.
Журналы «Современник» и «Русское слово», проповедовавшие передовые мысли, по высочайшему повелению были прекращены; министр народного просвещения Головнин получил отставку, и на его место назначен обер-прокурор Святейшего синода граф Д.А. Толстой; обер-полицмейстером Петербурга был назначен генерал Трепов; вместо князя Долгорукова шефом жандармов назначен граф П.А. Шувалов, бывший генерал-губернатор Прибалтийского края.
13 мая 1866 года Александр Второй обратился к председателю Комитета министров князю Гагарину с обращением, которое просил довести до сведения всех министров и государственных деятелей: «Единодушные изъявления верноподданнической преданности и доверия ко мне вверенного Божиим Промыслом управлению моему народа служат мне залогом чувств, в коих я нахожу лучшую награду за мои труды для блага России. Чем утешительнее для меня сие сознание, тем более признаю я моею обязанность охранять русский народ от тех зародышей вредных лжеучений, которые со временем могли бы поколебать общественное благоустройство, если бы развитию их не было поставлено преград. Событие, вызвавшее со всех концов России доходящие до меня верноподданнические заявления, вместе с тем послужило поводом к более ясному из тех путей, которыми приводились и распространялись эти пагубные лжеучения. Исследования учрежденною, по моему повелению, особою следственною комиссиею, уже указывают на корень зла. Таким образом Провидению угодно было раскрыть перед глазами России, каких последствий надлежит ожидать от стремлений и умствований, дерзновенно посягающих на все для нее искони священное, на религиозные верования, на основы семейной жизни, на право собственности, на покорность закону и на уважение к установленным властям. Мое внимание уже обращено на воспитание юношества. Мною даны указания на тот конец, чтобы оно было направляемо в духе истин религии, уважения к правам собственности и соблюдения коренных начал общественного порядка, и чтобы в учебных заведениях всех ведомств не было допускаемо ни явное, ни тайное проповедание тех разрушительных понятий, которые одинаково враждебны всем условиям нравственного и материального благосостояния народа. Но преподавание, соответствующее истинным потребностям юношества, не принесло бы всей ожидаемой от него пользы, если бы в частной, семейной жизни проводились учения, несогласные с правилами христианского благочестия и с верноподданническими обязанностями. Посему я имею твердую надежду, что видам моим по этому важному предмету будет оказано ревностное содействие в кругу домашнего воспитания. Не менее важна для истинных польз государства в его совокупности и, в частности, для каждого из моих подданных полная неприкосновенность права собственности во всех его видах, определенных общими законами и положениями 19 февраля 1861 года. Независимо от законности сего права, одного из самых коренных оснований всех благоустроенных обществ, оно состоит в неразрывной связи с развитием частного и народного богатства, тесно между собою соединенных. Возбудить сомнения в сем отношении могут одни только враги общественного порядка. К утверждению и охранению сих начал должны стремиться все лица, облеченные правами и несущие обязанности государственной службы. В правильном государственном строе первый долг всех призванных на служение мне и отечеству состоит в точном и деятельном исполнении своих обязанностей, без всякого от видов правительства уклонения. Превышение и бездействие одинаково вредны. Одним лишь неуклонным исполнением сих обязанностей может быть обеспечено единство в действиях правительства, которое необходимо для осуществления его видов и достижения его целей. Мне известно, что некоторые из лиц, состоящих на государственной службе, принимали участие в разглашении превратных слухов или суждений о действиях или намерениях правительства и даже в распространении тех противных общественному порядку учений, которых развитие допускаемо быть не должно. Само звание служащих дает в таких случаях больше веса их словам и тем самым способствует искажению видов правительства. Подобные беспорядки не могут быть терпимы. Все начальствующие должны наблюдать за действиями своих подчиненных и требовать от них того прямого, точного и неуклонного исполнения предуказанных им обязанностей, без которого невозможен стройный ход управления и которым они сами должны подавать пример уважения к власти. Наконец, для решительного успеха мер, принимаемых против пагубных учений, которые развились в общественной среде и стремятся поколебать в ней самые коренные основы веры, нравственности и общественного порядка, всем начальникам отдельных правительственных частей надлежит иметь в виду содействие тех других, здравых, охранительных и добронадежных сил, которыми Россия всегда была обильна и доселе, благодаря Бога, и преизобилует. Эти силы заключаются во всех сословиях, которым дороги права собственности, права обеспеченного и огражденного законом землевладения, права общественные, на законе основанные и законом определенные, начала общественного порядка и общественной безопасности, начала государственного единства и прочного благоустройства, начала нравственности и священные истины веры. Надлежит пользоваться этими словами и сохранять в виду их важные свойства при назначении должностных лиц по всем отраслям государственного управления. Таким образом обеспечится от злонамеренных нареканий во всех слоях народа надлежащее доверие к правительственным властям. В этих видах, согласно всегдашним моим желаниям и неоднократно выраженной мною воле, надлежит по всем частям оказывать полное внимание охранению прав собственности и ходатайствам, относящимся до польз и нужд разных частей населения. Надлежит прекратить повторяющиеся попытки к возбуждению вражды между разными сословиями и, в особенности, к возбуждению вражды против дворянства и вообще против землевладельцев, в которых враги общественного порядка усматривают своих прямых противников. Твердое и неуклонное соблюдение этих общих начал положит предел тем преступным стремлениям, которые ныне с достаточной ясностью обнаружились и должны подлежать справедливой каре закона. Поручаю вам сообщить настоящий рескрипт мой для надлежащего руководства всем министрам и главноначальствующим отдельными частями».
Выслушав чтение этого рескрипта, а потом еще и перечитывая его, Дмитрий Милютин увидел в этом рескрипте то, что было близко и дорого ему, как гражданину и деятелю Военного министерства… Воспитание юношества в строгом соответствии с православной верой, укрепление семьи, права собственности, соблюдение коренных начал общественного порядка, ни явное, ни тайное проповедание разрушительных понятий – все это укрепляет нравственные основы юношеского характера, которые затем становятся солдатами, офицерами, генералами, все это укрепляет армию как защитницу Отечества. Да и многое другое из рескрипта очень своевременное и полезное для граждан России. Не менее полезна и мысль императора о том, что необходимо развивать частное и народное богатство, помещики и простой крестьянин одинаково важны для императора… И упоминание законов и положений, начатых 19 февраля 1861 года, тоже весьма актуально, ведь реформы только начались, многое еще предстоит сделать в России. И сколько уж говорилось о единстве правительства, превышение и бездействие власти одинаково вредны, тем более если в правительстве существуют разные точки зрения на коренные преобразования в стране… Сколько уж раз Дмитрию Милютину приходилось возражать и спорить с Валуевым, Долгоруковым, Рейтерном, а что получалось в итоге, – полумеры, ни то ни се…
Во время недавней поездки в Москву император дал аудиенцию Михаилу Никифоровичу Каткову, который, чтобы получить ее, сначала написал письмо графу Адлербергу он ни на что не жалуется и ничего не просит, только повидать, он хочет, чтобы государь признал его как своего… Но дело было не таким уж простым: министр Валуев предупредил Каткова за его публицистику, слишком резка, особенно против Министерства народного просвещения, его критика излишне патриотична и выходит за пределы допустимого, Катков не напечатал предупреждение министра, а это серьезное нарушение… Император в то время поддержал Валуева.
20 июня в Петровском дворце Александр Второй принял Каткова, приветствуя, слегка обнял его и добродушно улыбнулся:
– Я знаю тебя, верю тебе и считаю тебя своим.
Катков расстроился от такого доброго приема, невольно брызнули и слезы, он потянулся за платком, навернулись слезы и у императора.
– Сохрани тот священный огонь, который есть в тебе. Я подаю руку тем, кого знаю и уважаю, – говорил император. – Тебе не о чем беспокоиться. Я внимательно слежу за «Московскими ведомостями», постоянно