Этот фанатик уничтожил фратичелли Италии, катаров Боснии, гуситов Венгрии. В начале 1437г. к югу от Дуная он предавал смерти всех, кто отказывался обратиться, и предотвратил в Сремской епархии восстание гуситов. Евгений назвал Джакомо «энергичным и неумолимым истребителем ереси» и предоставил ему право назначать себе помощников, так что сам он являлся как бы генерал-инквизитором порученной ему провинции. Благодаря его стараниям 25 апреля 1438 г. бароны и города Польши образовали лигу для истребления ереси; это произошло накануне вступления Польши в Чехию на защиту гуситов от императора Альберта. В 1439 г. инквизитор Джакомо выдал в Среме в руки светских властей, как еретиков, одного священника и трех его единомышленников. Друзья осужденных освободили узников. Архиепископ Калочи принял сторону не инквизитора, а обвиняемых. В 1440 г. Джакомо покинул Венгрию, и на его место никто не был назначен. В январе 1444 г. Евгений IV ввиду распространения гуситизма назначил инквизитором в Славонию и Венгрию викария обсервантинов; ему было предоставлено право назначать себе помощников, которые пользовались полною независимостью от местных епископов. Всем, кто будет оказывать им помощь, были обещаны индульгенции; тем же, кто откажется помогать, грозило отлучение от Церкви, которое мог снять только папа или инквизитор. В июле 1446 г. Евгений снова упоминает о распространении гуситизма в Венгрии и Молдавии.
Рим даже во время своей ссоры с отцами Базельского собора проявлял энергию в подавлении гуситизма и пренебрегал Compactata. Николай V совершенно не обращал внимания на договор, подписанный собором, и видел в утраквистах только простых еретиков. Тщетно чехи предлагали покорность, если только будут подтверждены Compactata, причем подразумевалось и признание папой Рокицаны пражским архиепископом. Но папство стояло твердо и скорее залило бы огнем и кровью весь христианский мир, чем признало, что Базельский собор имел право купить мир уступкой гуситам в вопросе о причастии. Кроме того, оставался еще вопрос о признании Рокицаны. Папские соглядатаи в своих донесениях в Рим изображали Рокицану как самого нечестивого и вероломного еретика: признать его означало бы нанести смертельный удар остаткам католичества в Чехии. И поэтому Рим никогда и не думал его утверждать.
Когда падение Мейнгарда из Розенберга сосредоточило всю власть в руках Юрия Подебрада, Николай V направил в Чехию инквизитора-миссионера, викарного генерала францисканцев-обсервантинов Джованни да Капистрано, инквизитора с 1417 г. В 1451 г. он уничтожал фратичелли; но по просьбе Николая прервал это кровавое дело, чтобы заняться обращением гуситов. Его инквизиторская власть была распространена на чешские области.
Несмотря на просьбу императора, Подебрад и Рокицана категорически запретили Капистрано посетить Прагу. Генерал с письмами императора к католическим вельможам и их главе Ульриху Мейнгарду из Розенберга отправился в июле в Моравию. Епископом в Ольмюце был католик, и Капистрано не встретил никаких препятствий при обращении еретиков-гуситов. Он начал действовать в Брюнне (Брно) 1 августа 1451 г. и к маю 1452 г. произвел более одиннадцати тысяч обращений. Однако он не имел права применять инквизиционные приемы. Когда обращения бывали добровольные, он воссоединял кающихся с Церковью, накладывая на них епитимьи, и оставлял за ними имущество и должности. В случае же упорства еретиков Капистрано приходилось ограничиваться только убеждением, не прибегая ни к тюрьме, ни к костру.
В начале миссии Капистрано Рокицана в дружеских выражениях упрекал инквизитора, что он осуждает как ересь причастие под двумя видами, разрешенное чехам Базельским собором. Но генерал требовал «взятия назад чаши» и признания главенства папы. Капистрано, сделав таким образом невозможными дружеские переговоры с утраквистами, тем не менее в 1452 г. потребовал от Подебрада помощи и покровительства, которые должны были оказываться папскому уполномоченному и инквизитору.
В 1452 г. чехи обратились с жалобами к сейму немецких князей. Они указывали на свою покорность Св. Престолу и на то, что условия Compactata, запрещающие считать еретиками причащающихся под двумя видами, нарушены монахом Капистрано, именующим себя папским уполномоченным и инквизитором, который объезжает чешские земли, объявляя всех утраквистов еретиками. Со своей стороны Капистрано в письме к папе осуждал предложения примирения, сделанные кардиналом-легатом, и сообщал, что надеется на успех переговоров с немецкими князьями о новом крестовом походе против гуситов. Легат Николай Куза в июне 1452 г. обратился к чехам с энцикликой. В ней он ясно говорил им, что всякий, кто не с Церковью, тот против нее; что следует забыть Compactata, так как это соглашение якобы не привело к единению, и требовал только полного и простого повиновения Св. Престолу. Чтобы вызвать еще большее возмущение, он с удивительным цинизмом ручался им, что Церковь настолько добрая мать, что не может позволять своим детям то, что вредно для них.
Конец 1452 г. Капистрано посвятил объезду Германии с целью поднять крестовый поход против чехов. Но его старания остались безуспешными вследствие взятия Константинополя турками в мае 1453 г. и всеобщей паники, вызванной этим.
Из Бреславля Капистрано летом 1453 г. отправился в Польшу и в Кракове заключил в тюрьму медика- магистра, на которого пало подозрение, что он был доверенным Рокицаны. Из Польши он снова послал Подебраду просьбу о выдаче ему охранного листа для проезда в Прагу; ему отказали, сославшись на прежний отказ и указав, что король Владислав не желает нарушать спокойствие в своем королевстве. 15 мая 1454 г. Капистрано покинул Краков и отправился в Бреславль и Ольмюц, откуда он надеялся проникнуть в Чехию. В письме от 13 июня король Владислав просил ольмюцского епископа заставить молчать Капистрано, который, в резких выражениях обличая чехов, приносил больше вреда, чем пользы.
С лета 1454 г. до лета 1455 г. по просьбе Энея Сильвия Пикколомини деятельность Капистрано была поглощена борьбой против турок, и гуситы на время были оставлены в стороне.
Избранный 8 апреля 1455 г. новый папа Каликст III немедленно послал легатов проповедовать по всей Европе крестовый поход против турок. Венгры, особенно обеспокоенные грозящим вторжением Мухаммеда II, просили Капистрано поддержать их. С разрешения Каликста, подтвердившего все данные Николаем привилегии, Капистрано принялся за организацию крестового похода. Однако Капистрано не терял из виду ненавистных гуситов. Момент казался благоприятным для примирения ввиду угрозы турецкого вторжения, и чехи надеялись добиться не только утверждения Compactata, но и красной шапки для Рокицаны. Но Капистрано 24 марта 1456 г. писал из Будапешта Каликсту, убеждая его не идти на примирение с чехами. Воззвание инквизитора было услышано, и все предложения компромисса были отвергнуты Римом. Неожиданно пришла весть, что Мухаммед II осадил Белград. Регент Венгерского королевства, граф Трансильванский Ян Гуниади, при помощи некоторых немецких крестоносцев собрал венгерские силы; к нему же присоединился Капистрано в качестве духовного вождя крестового похода. В боях с 14 июля по 22 июля 1456 г. войско Гуниади и гарнизон Белграда полностью разбили армию Мухаммеда. Это поражение вместе с геройским сопротивлением, оказанным Скандербегом в Албании, остановило турецкое вторжение. Но 11 августа от эпидемии умер Ян Гуниади. Эта смерть помешала победителям воспользоваться должным образом своей победой.
Красноречие Капистрано вызвало у христианского войска лихорадочный приступ религиозного возбуждения; деятельность его была неутомима. Но 23 октября, когда был нанесен неверным последний удар, он умер. Друг и соперник Капистрано, Джакомо делла Марка, в 1457 г. занял его место. Ему были даны те же полномочия инквизитора и крестоносца. Турецкая опасность была еще настолько грозна, что Джакомо не мог тратить свое время на преследование и всецело посвятил себя организации войны против ислама; когда он вернулся в Италию, ему (францисканцу) пришлось защищаться от обвинения в ереси, выдвинутого против него доминиканцами. Его преемниками были его ученики. Хотя францисканцы в течение целого поколения работали над обращением утраквистов, однако успеха они не имели, так как не могли прибегать к обычным инквизиционным приемам.
Надежда привести Чехию к повиновению с каждым днем становилась все слабее. Во время гуситских войн нашлись могущественные бароны и города, готовые энергично поддерживать папу и императора. Во время междуцарствия сначала было смешанное управление, одинаково разделенное между католиками и утраквистами. При правлении Подебрада католические города были покорены один за другим, а в духовных вопросах всемогущим стал утраквист Рокицана. Правда, в учении и порядках двух Церквей разница была не велика, кроме вопроса об употреблении чаши; но независимость спасала от алчности римской курии. После избрания и коронования в 1458 г. Юрия Подебрада у Рима не осталось надежд на мирное возвращение чехов в лоно Церкви.
Однако вначале соглашение казалось возможным. Незадолго до своей смерти в конце 1457 г. Владислав предполагал послать в Рим посольство с целью добиться примирения, и Каликст III выразил желание видеть