Охрана водного района Главной базы включала в себя тральщики Т-404, Т-405, Т- 406, Т-407, Т-408, Т-409, Т-410, Т-412, Т-413; минный заградитель «Островский»; сетевой заградитель «Сетевик» и 14 сторожевых катеров.
Кроме этого в Феодосии в распоряжении Научно-исследовательского минно-торпедного института находились тральщики Т-403, Т-411 и «Джалита».
Одесская военно-морская база включала:
— Отдельный дивизион канонерских лодок в составе «Красная Абхазия», «Красная Грузия», «Красная Армения», «Красный Аджаристан»;
— охрану водного района в составе четырех сторожевых катеров;
— 42-й отдельный артиллерийский дивизион в составе 411-й трехорудийной 180-мм батареи, 1-й трехорудийной 152-мм батареи, 39-й трехорудийной 130-мм батареи, 718-й трехорудийной 130-мм батареи;
— 44-й отдельный артиллерийский дивизион в составе 412-й 180-мм трехорудийной батареи, 21-й 203 -мм трехорудийной батареи;
— 73-й зенитный артиллерийский полк в составе 16-го дивизиона (12 76-мм орудий) и 53-го дивизиона (12 76-мм орудий);
— пулеметный батальон;
— прожекторный батальон;
— химическая рота;
— отдельный стрелковый взвод;
— минная партия.
Кроме этого Одесской ВМБ была придана вторая бригада торпедных катеров, и в ее состав входил Очаковский сектор береговой обороны:
— 15-я отдельная 203-мм четырехорудийная батарея (Очаков);
— 22-я отдельная 203-мм четырехорудийная батарея (о. Первомайский);
— 7-я отдельная 75-мм четырехорудийная батарея (м. Очаковский);
— 2-й отдельный зенитный артиллерийский дивизион (12 76-мм орудий);
— пулеметный батальон;
— прожекторный батальон;
— саперная рота;
— отдельная местная стрелковая рота;
— взвод связи.
Новороссийская военно-морская база включала:
— учебный дивизион подводных лодок в составе Щ-201, Щ-202 (в Феодосии), Щ-203 (ремонт в Севастополе), М-51 (ремонт в Севастополе), М-52, М-54 (ремонт в Очакове), М-55 (ремонт в Севастополе), плавбаза «Очаков»;
— отряд торпедных катеров (6 ед.);
— 72-й отдельный артиллерийский дивизион в составе 16-й железнодорожной 180-мм четырехорудийной батареи (Туапсе), 23-й 152-мм четырехорудийной батареи (м. Кодош);
— 31-я 152-мм четырехорудийная батарея (м. Мысхако);
— 714-я 130-мм трехорудийная батарея (Геленджик, м. Тонкий)
— охрана рейдов (два катера);
— отдельная железнодорожная рота;
— стрелковый взвод;
— минная партия.
Кроме этого в ВМБ входил Керченский сектор береговой обороны:
— 29-я отдельная 180-мм четырехорудийная батарея (м. Тобочик);
— 33-я отдельная 203-мм трехорудийная батарея (м. Панагия);
— 48-я отдельная 152-мм четырехорудийная батарея (Керчь, Крепость);
— 54-й отдельный зенитный артиллерийский дивизион (12 76-мм орудий);
— пулеметная рота;
— прожекторная рота;
— отдельная местная стрелковая рота;
— минная партия.
Военно-морская база Батуми включала:
— отдельный дивизион торпедных катеров (в Поти, 12 ед.);
— охрана рейдов;
— 431-я 180-мм четырехорудийная батарея;
— 52-я 203-мм четырехорудийная батарея;
— 51-я 152-мм четырехорудийная батарея;
— 716-я 130-мм трехорудийная батарея (Поти);
— 57-й отдельный зенитный артиллерийский дивизион (16 76-мм орудий);
— пулеметная рота;
— прожекторная рота;
— отдельная местная стрелковая рота;
— минная партия.
Кроме этого ВМБ были приданы эскадренные миноносцы «Фрунзе» и «Дзержинский», подводная лодка А-4.
Николаевская военно-морская база включала:
— дивизион вновь строящихся и капитально ремонтирующихся подводных лодок в составе С-35 (на стапеле), Щ-216 (на ходовых испытаниях в районе Главной базы), М-111 (на заводских испытаниях), М-112 (на заводских испытаниях), М-113 (на заводских испытаниях), М-117 (на достройке), М-118 (на достройке), М-120 (на достройке), Л-23 (на заводских испытаниях), Л-24 (на достройке), Л-25 (на достройке);
— эскадренный миноносец «Свободный» (на достройке);
— 122-й зенитный артиллерийский полк (36 76-мм орудий);
— пулеметный батальон;
— прожекторный батальон;
— рота ВНОС;
— отдельная местная стрелковая рота;
— минная партия.
Береговая оборона Главной базы включала:
— 1-й отдельный артиллерийский дивизион в составе 30-й 305-мм четырехорудийной батареи (Северная сторона, р. Бельбек), 35-й 305-мм четырехорудийной батареи (Казачья бухта), 20-й 203-мм четырехорудийной батареи (Северная сторона, р. Кача);
— 2-й отдельный артиллерийский дивизион в составе 12-й 152-мм четырехорудийной батареи (к северу от Константиновского равелина), 13-й 120-мм четырехорудийной батареи (к югу от Константиновского равелина), 2-й 100-мм четырехорудийной батареи (к северу от Константиновского равелина), 8-й 45-мм четырехорудийной батареи (к югу от 13-й батареи);
— 3-й отдельный артиллерийский дивизион в составе 18-й 152-мм четырехорудийной батареи (мыс Фиолент), 19-я 152-мм четырехорудийной батарея (при входе в Балаклавскую бухту);
— 116-й отдельный артиллерийский дивизион в составе 26-й 130-мм трехорудийной батареи (м. Чауда), 32-й 130-мм трехорудийной батареи (м. Киик-Атлама);
— 28-я отдельная 152-мм трехорудийная батарея (Ак-Мечетъ);
— местный стрелковый полк;
— саперная рота;
— химическая рота;
— рота местной ПВО.
Военно-воздушные силы флота:
— 63-я авиационная бомбардировочная бригада в составе 40-го авиационного полка (Сарабуз, пять
