Во время президентской избирательной кампании 2004 года в штабе Януковича, по словам Прутника, он занимался идеологией.
В политических кулуарах поговаривают, что весной 2005 года Эдуард Анатольевич призывал своих партийцев перейти к радикальным действиям, переименовав партию в Республиканскую партию регионов.
На парламентских выборах 2006 года Прутник курировал сектор коммуникаций в Партии регионов.
На выборах 2006 года избран в Верховную Раду по списку Партии регионов (№55) .
Был председателем подкомитета по вопросам правового обеспечения экономической, техногенной и экологической безопасности Комитета по вопросам национальной безопасности и обороны.
14 сентября 2006 года Верховной Радой назначен председателем Государственного комитета телевидения и радиовещания Украины.
По версии журнала «Фокус», в 2006 году Эдуард Прутник занял 17-ю позицию в рейтинге влиятельности среди представителей донецкого региона.
Взгляды
Эдуард Прутник за:
- создание мегаканала региональных общин;
- создание государственного органа, который будет продавать государственные и коммунальные газеты;
- создание Национальной академии телевидения и радиовещания;
- включение украинских каналов в пакет европейских кабельных сетей;
- создание нормативов минимального годового выпуска книг в расчете на одного гражданина;
- объявление конкурса на концепцию создания Общественного телевидения;
- реформирование «Укринформа»;
- сокращение штатов областных телерадиокомпаний;
- превращение «Укртелефильма» в продакшн-студию для «Мега-канала» .
Эдуард Прутник против:
- официальной регистрации интернет-СМИ;
- приватизации областных государственных телерадиокомпаний;
- политического контроля над общественным вещанием.
Империя бизнеса
По неофициальной информации, Эдуард Прутник контролирует следующие структуры:
- ОАО «Центральная обогатительная фабрика «Калининская»;
- Ассоциацию торгово-промышленных предприятий «Донбасский расчетно-финансовый центр»;
- ООО «Востоксельхозпродукт»;
В так называемую «группу Прутника», по данным интернет-издания proUA, входят следующие предприятия:
- ООО «Схидпроминвест»;
- ООО «Схидавтотранс»;
- АКБ ОАО «Славутич»;
- ЗАО финансовая группа «Страховые традиции»;
- АБ «Украинский бизнес банк»;
- ООО «Донбассинвестпром»;
- ООО «Веспром»;
- ООО ТС (Телеканал «НТН»);
- ООО «Восток-инвестпром»;
- ЗАО Машзавод;
- интернет-издание Forum.
В сентябре 2006 года Эдуард Прутник заявил, что продал свой пакет акций на «НТН». «Конечно, я не могу сказать, что я не общаюсь с людьми, которые причастны к каналу, но точно так же я общаюсь и с десятками других людей. Поверьте, я живу в нашей стране, я люблю нашу страну, у меня трое детей, которые живут, и будут жить в нашей стране, и я хочу, чтобы им не было стыдно за все то, что делал их отец», - заявил он.
В прессе муссировались слухи о возможной причастности Прутника к ООО «Торговый флот Донбасса» (через ООО «Веспром»).
«Коммерсант-Украина» утверждает, что Эдуард Прутник имеет отношение к компании «Украинский страховой дом», которая в 2007 году получила право на страхование пассажиров от несчастных случаев Юго-Западной железной дороги в 2007 году.
По данным газеты «Экономические известия», Прутник также имеет отношение к банку «Киевская Русь».
Компромат
На обнародованных в ноябре 2004 года Олегом Рыбачуком аудиозаписях, которые якобы свидетельствуют о существовании во время выборов «транзитного» сервера, звучит голос, похожий на голос Эдуарда Прутника.
Прутник заявил, что сомневается в подлинности этих записей.
Материальное положение
Эдуард Прутник владеет в столице квартирой на улице Январского восстания. О его реальных доходах точных данных нет.
Окружение
Прутник дружен с руководителем службы Премьер-министра Сергеем Левочкиным, Павлом Борулько, Игорем Еремеевым.
Регалии
Заместитель главы наблюдательного совета информационного агентства «Укринформ».
Председатель правления общественной организации «Экспертно-аналитический центр «Социум».
Кандидат экономических наук. Диссертация - «Формирование стратегии диверсификации развития углеобогатительных предприятий».
Член Политисполкома Партии регионов.
В свое время был председателем Донецкой областной организации Союза молодежи регионов, членом наблюдательных советов «Укртелекома», «Ощадбанка», «Укрэксимбанка».
Член Оргкомитета по проведению Евро-2012.
Член межведомственного координационного совета по созданию национальной спутниковой системы связи.
Награжден Почетной грамотой Кабинета Министров Украины.