Появление у душманов ПЗРК разного типа заставило изыскивать меры борьбы с новым видом оружия. В 1983 г. в Центре под руководством профессора ЦАГИ Каргопольцева проводились исследования по тепловой заметности вертолетов. Результатом этих исследований стало появление на вертолетах ЭВУ и рекомендации по изменению мест установки устройств отстрела ложных целей.
Крайне эффективным средством поражения ПЗРК оказались ФОТАБы, ответственным исполнителем по этой теме являлся полковник В.А. Хохлов. Мощная вспышка бомбы выводила из строя чувствительные элементы головок самонаведения зенитных ракет, слепила операторов.
Еще одним необычным оружием вертолетчиков для работы «по земле», стали ракеты класса «воздух -воздух». В Афганистане УР воздух-воздух с большим эффектом применялись для ночной охоты за караванами. Прицеливание выполнялось по фарам с помощью обычного дневного прицела. Пуск ракеты выполнялся в момент разделения одного пятна от фар на два, в этот момент дистанция до машины составляла примерно 4 км, и тепловая головка самонаведения ракеты надежно захватывала цель.
Опыт боевых действий в Афганистане обобщался ежегодно, в 1986 г. с учетом афганского опыта вместо старого КБП, который также создавался в Торжке, был разработан новый курс боевого применения.
С начала 80-х годов в Торжке велись и работы по ночным системам для вертолетов. Первые прицелы крепились на ЗШ. Сначала летчики проверили их «пеший по летному» -походили ночью по аэродрому. Затем опробовали в полетах. Прицелы получились чересчур тяжелыми. Ночные прицелы широкого распространения не получили. С очками ночного видения получилось лучше.
Большое внимание уделялось отработке сложного пилотажа на режимах малых скоростей и висения. Исследовалось поведение вертолетов в режиме «подхвата».
В 1986 году личный состав Центра принимал участие ликвидации аварии на Чернобыльской АЭС. 27 апреля части Центра были подняты по тревоге. После краткого совещания подполковнику С.А. Кузнецову была поставлена задача - срочно перебазироваться в Чернигов на аэродром Черниговского ВВАУЛ. В Чернигов эскадрилья прибыла в 15 ч, спустя семь часов после сигнала «тревога». В 22.00 командующий ВВС Киевского военного округа генерал-майор Н.Т. Антошкин поставил конкретную задачу - всем экипажам выполнять полеты на блокировку взорвавшегося блока АЭС. В четыре часа утра 28 апреля экипажи приступили к блокировке блока, сбрасывая в образовавшийся после взрыва развал реактора тонны песка и свинца. В первый день экипажи работали одиночно, в последующие - «каруселью». За смену один экипаж выполнял по 10 - 15 полетов; вертолеты работали над реактором все светлое время суток.
Выполнялась не только засыпка реактора - с вертолета подполковника Н.А. Мезенцева выполнялась телесъемка поврежденного энергоблока, для чего вертолет длительное время находился в районе реактора. Через пять дней весь летный состав получил предельно допустимые дозы радиации и убыл из зоны катастрофы. За эти пять дней, с 28 апреля по 2 мая была выполнена основная работа по заглушке реактора. Всего же с апреля 1986 г. по декабрь 1987 г. в ликвидации последствий аварии приняло участие около 90 военнослужащих Центра. Кроме того, экипажи и специалисты из Торжка привлекались к ведению радиационной разведки пострадавших от радиации районов Брянской и Смоленской областей, Украины и Белоруссии, проводили комплексные мероприятия по дезактивации авиационной техники, перегоняли в пункты утилизации вертолеты с недопустимо высоким уровнем радиоактивного загрязнения.
6 мая 1991 г. полковникам Н.А. Мезенцеву, Е.И. Мещерякову, подполковникам СВ. Кузнецову, А.А. Муржухину, В.А. Прасолову, Н.И. Шевердину и майору В.А. Куликову были вручены награды Американского вертолетного общества -«Диплом имени капитана Уильяма Дж. Косслера». Такая награда присуждается за выдающиеся достижения в области практического применения винтокрылых летательных аппаратов, впервые Диплом получили российские вертолетчики. В пояснительном тексте Диплома сказано: «… Американское вертолетное общество присуждает данную награду летчикам, участвовавшим в начальных вертолетных операциях по ликвидации аварии ядерного реактора в Чернобыле, в знак признания продемонстрированного ими мужества и самообладания».
С декабря 1994 г. личный состав Центра принимал участие в контртеррористических операциях на Северном Кавказе.
Центр также является базой для формирования, подготовки и проведения ротаций Российской авиагруппы в составе миротворческих сил ООН. Личный состав Центра в составе РАГ принимал участие в миссиях ООН в Кампучии, Анголе, Югославии, Сьерра-Леоне, Судане, Чаде, Центрально-Африканской республике.
Большое внимание в Центре всегда уделялось освоению новой техники. Первым Ка-50 освоил начальник Центра генерал-майор Б.А. Воробьев, причем в такой степени, что именно ему, а не летчикам- испытателям было доверено демонстрировать пилотажные возможности «Черной Акулы» на международных авиасалонах в Ле-Бурже (1993 г.), Дубае (1995 г.), Лиме (1995 г.), Фарнборо (1996 г.), Абу-Даби (1997 г.). Показательно, что техническое обслуживание Ка-50 на авиасалонах в Лиме и Абу-Даби выполнял инженерно-технический состав Центра - подполковник Ю.Ф. Нестеренко, майоры B.C. Куценко и Р.С. Чернышев, капитаны А.Л. Коробков и В.В. Мясумов. Кроме генерал-майора Воробьева Ка-50 на выставках пилотировали полковники А.В. Рудых и В.В. Ханыков, подполковник СП. Золотое. Указом Президента РФ от 20 июля 1996 г. генерал-майору Б.А. Воробьеву за мужество и героизм, проявленные при испытании новой авиационной техники в условиях, сопряженных с риском для жизни, присвоено звание Героя Российской Федерации.